生殖器疱疹的初期症状是HSV病毒传染的一种全身性疾病，此类疾病的病毒通过呼吸道、口腔、生殖器粘膜或破损皮肤进入人体，在生殖器疱疹疾病的情况上也可能出现在人体正常粘膜、血液、唾液以及局部感受神经节和多半器官之内，目前所有的内脏和粘膜表皮内都会出现离散到HSV的情况。
根据调查显示目前我国的生殖器疱疹的初期症状是原发感染多为隐性，大多无临床症状或呈亚临床表现，仅有少数可以出现临床症状。主要见于免疫功能低下婴幼儿或严重营养不良或有其它感染的儿童，成人罕见。原发感染消退后，病毒可持续潜居体内。正常人中约有半数以上为本病毒的携带者，可通过口、鼻分泌物而成为传染源，由于HSV在人体中不产生永久免疫力，所以人体的机体抗病能力在逐渐的减退。
还有些患者的生殖器疱疹的初期症状是HSV感染的潜伏期为1-45天，平均为6天，HSV-1感染主要发生于口角、唇缘、鼻孔等皮肤粘膜交界处，亦可见颜面或口唇，开始局部先有灼痒及轻度紧张感，偶有伴发神经痛。随即出现红斑，在红斑基础上发生簇集性小丘疹，迅速变为粟粒至绿豆大小的水疱，内容澄清，水疱破裂后出现糜烂面，在几日后患处就会出现干燥结痂的。
生殖器疱疹的初期症状会很快在红斑的底部的根基上出现成群的小水疱，常见于男性包皮、龟头、冠状沟、阴茎等地方，偶而可能看见于尿道的地方;常见的女性于阴唇、阴蒂、阴道、宫颈等处。水疱可逐渐行成脓疱，大约在6天的时间破溃而导致腐败或浅的溃疡，自发痛苦悲伤。病人可发生尿道炎，泛起排尿难题。多半人有腹股沟淋巴趋承肿不小痛苦，有的患者可引起发烧、肌肉痛及脑膜炎等不同的症状。
